Profil pondok pesantren Sunan Bonang berdiri untuk memenuhi harapan masyarakat akan pentingnya lembaga pendidikan agama yang dikelola oleh ulama berbasis pesantren bersama pribadi yang berkompeten dalam dunia kepesantrenan, sehingga keberadaan Pesantren bisa menjalankan tugas dan tanggung jawab dakwah syiar agama sebagaimana yang telah dirintis oleh ulama pewaris nabi pendahulu (Salafus Shalih) yang ada di Indonesia.